Bernhard Marx è stato allievo d’organo di Marie-Claire Alain (Parigi), di Ludwig Doerr (Saarbrücken - Freiburg) e di Gaston Litaize (Parigi); inoltre ha partecipato a diversi corsi internazionali di perfezionamento con Anton Heiller (Vienna) e con Luigi Ferdinando Tagliavini (Bologna). Dal 1972 al 1975 gli è stata concessa una borsa di studio del Deutscher Akademischer Austauschdienst Bonn per i suoi studi a Parigi. Nel 1973 ha vinto il 3° Premio del Concorso Internazionale d’Organo Johann Sebastian Bach a Bruges. Ha registrato per enti radiofonici e televisivi ed ha inciso vari dischi; ha tenuto concerti nei vari paesi europei, Stati Uniti, Canada, Messico, Brasile, Uruguay, Argentina e Giappone. Dal 1972 è organista titolare nella Johanneskirche a Friburgo in Bresgovia e professore d’organo presso l'Accademia Pedagogica della stessa città. Nel 1976 ha terminato i suoi studi conseguendo il diploma di concertista (“Prix d’excellence”) nella classe del prof. Doerr. Nel 1979 ha ottenuto il 2° Premio al Concorso Internazionale d’organo di Saarbrücken. Dall' anno accademico 1979/1980 è stato nominato professore d’organo alla Hochschule für Kirchenmusik di Rottenburg e dal 1987 esperto per il restauro e la costruzione d'organi presso l'arcidiocesi di Friburgo. Dal 1997 è direttore artistico del famoso Festival Internazionale di musica sacra nel Duomo di St. Blasien (Selva nera) (www.st-blasien.de) e dal 2011 organista titolare presso lo stesso duomo.